В Ubuntu 12.04 столкнулся с проблемой, когда меню моей любимой идешки сливается с цветом заголвка окна. Изза этого очень не удобно стало работать. Нашел простое решение данной проблемы, достаточно отредактировать файл netbeans.conf, который находится в директории установки netbeans (например: /home/user/netbeans7.2/etc)

 В конец файл добавляем следующую диррективу:

 -J-Dswing.aatext=true -J-Dawt.useSystemAAFontSettings=lcd —laf Metal 

Более детальную информацию о решении проблмемы см:

http://hanynowsky.wordpress.com/2012/04/27/netbeans-ide-look-feel-under-ubuntu-12-04/

Не помогло?

Тогда ищем файлик  /usr/share/themes/Ambiance/gtk-2.0/gtkrc, открываем его для редактирования от имени админа

sudo gedit /usr/share/themes/Ambiance/gtk-2.0/gtkrc

Находим строку 338 с текстом 

style «menu» {

и меняем ее на

style «menu» = «dark» {

Сохраняем и перезапускаем NetBeans (если он был запущен)…